清远鸡的原种曾濒临消失。清远鸡能以清远地名而获其名无疑就是对其品种纯正的肯定。改革开放以前，中国以农为本的国策在计划经济体制下保证了其品种在清远延续千万年而不曾有变。然而，随着国门的打开，以广东为开放前沿的社会生产力迅速提高，从而带动了外来鸡类品种的渗入。1980年代始，清远农户为提高产量，多有选养成长期短、个头大的“石岐杂”等品种，后来更是多种引进，到1998年，清远鸡已被列入国家级畜禽遗传资源保护、濒危保种项目。1998年的国家权威的濒危保种认定无疑使清远鸡家族重新获得新生。清远市从此就清远鸡的品种保护及外来品种的引进开始设立标准以保证清远鸡的原种基因不受破坏。2003年，清远（麻）鸡注册了“原产地证明商标”，成为广东首个活禽”注册地理标志“。2010年，“清远鸡”又成为“地理标志保护产品”，并被列入《中国家禽品种志》，成为中国27个优质地方品种之一。 

　　清远鸡原种基因库在天农诞生。政府的重视和品种的回归反而吸引了人才对清远鸡发展的关注和青睐。2004年拥有双博士头衔和高级畜牧师职称的重庆女子张莹开办了广东天农食品有限公司。自此，清远鸡终于有了其父、母本的归宿基因库。凭借着丰富的学识和养殖经验，张莹敏锐地看到了清远鸡基因的宝贵以及其基因所带来的品牌价值。在得到4000万风投基金的支持后，张莹首先就瞄准了清远鸡种保护和培育的领域。而这个领域恰恰是政府和农户间的短板，因为政府有技术但缺市场，农户会养殖却不懂培育。当天农清远鸡原种鸡场在毗邻清远黄腾峡景区的绿水青山选址设定后，国家农业部就将其指定为清远麻鸡原种保种基地，而这个唯一的清远鸡保种基地也从此承担起了国家清远麻鸡品种保护的重任。目前，天农公司拥有一个超过230人的专职团队，从事清远鸡的育种、种鸡养殖和孵化工作，年产供应清远鸡混合苗鸡6000万羽以上。而天农则在此基础上，实现了“从种源到餐桌”一条龙的标准化经营。